MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanotorris igneus Kol 5 chromosome

Total Repeats: 50717

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015562	T	6	6	36941	36946	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_015562	CAT	2	6	36976	36981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_015562	TAA	2	6	37008	37013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_015562	TA	3	6	37060	37065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_015562	TA	3	6	37093	37098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_015562	GTC	2	6	37105	37110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_015562	GGT	2	6	37114	37119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_015562	TGTA	2	8	37167	37174	25 %	50 %	25 %	0 %	333909926
1009	NC_015562	TA	3	6	37173	37178	50 %	50 %	0 %	0 %	333909926
1010	NC_015562	CAG	2	6	37223	37228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333909926
1011	NC_015562	CTT	2	6	37277	37282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333909926
1012	NC_015562	ATG	2	6	37304	37309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333909926
1013	NC_015562	TGT	2	6	37323	37328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333909926
1014	NC_015562	TAAA	2	8	37358	37365	75 %	25 %	0 %	0 %	333909926
1015	NC_015562	AAC	3	9	37386	37394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333909926
1016	NC_015562	ACA	2	6	37419	37424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333909926
1017	NC_015562	CATC	2	8	37438	37445	25 %	25 %	0 %	50 %	333909926
1018	NC_015562	AAAT	2	8	37487	37494	75 %	25 %	0 %	0 %	333909926
1019	NC_015562	TTC	2	6	37542	37547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333909926
1020	NC_015562	ATT	2	6	37566	37571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333909926
1021	NC_015562	AAT	2	6	37575	37580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333909926
1022	NC_015562	AAT	2	6	37605	37610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333909926
1023	NC_015562	AT	3	6	37609	37614	50 %	50 %	0 %	0 %	333909926
1024	NC_015562	AATAA	3	15	37615	37629	80 %	20 %	0 %	0 %	333909926
1025	NC_015562	ATA	2	6	37639	37644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_015562	CAT	2	6	37661	37666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_015562	T	6	6	37699	37704	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_015562	TA	3	6	37746	37751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_015562	TGAA	2	8	37760	37767	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_015562	TAAA	2	8	37788	37795	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_015562	AAATA	2	10	37806	37815	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_015562	CTT	2	6	37838	37843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_015562	T	6	6	37842	37847	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_015562	T	6	6	37857	37862	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_015562	TTG	2	6	37885	37890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_015562	GTT	2	6	37897	37902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_015562	ATTT	2	8	37936	37943	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_015562	T	6	6	37941	37946	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_015562	AAG	2	6	37988	37993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_015562	AAC	2	6	38001	38006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_015562	GA	3	6	38097	38102	50 %	0 %	50 %	0 %	333909927
1042	NC_015562	AGG	2	6	38116	38121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333909927
1043	NC_015562	AGA	2	6	38141	38146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333909927
1044	NC_015562	TGT	2	6	38150	38155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333909927
1045	NC_015562	GCA	2	6	38196	38201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333909927
1046	NC_015562	A	7	7	38210	38216	100 %	0 %	0 %	0 %	333909927
1047	NC_015562	A	6	6	38258	38263	100 %	0 %	0 %	0 %	333909927
1048	NC_015562	GAA	2	6	38270	38275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333909927
1049	NC_015562	TAA	2	6	38276	38281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333909927
1050	NC_015562	TGT	3	9	38345	38353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333909927
1051	NC_015562	TAA	2	6	38377	38382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333909927
1052	NC_015562	AAGTTA	2	12	38392	38403	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	333909927
1053	NC_015562	AG	3	6	38419	38424	50 %	0 %	50 %	0 %	333909927
1054	NC_015562	ATT	2	6	38448	38453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333909927
1055	NC_015562	TTG	2	6	38482	38487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333909927
1056	NC_015562	TAT	2	6	38508	38513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333909927
1057	NC_015562	TAA	2	6	38582	38587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333909927
1058	NC_015562	AGA	2	6	38588	38593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333909927
1059	NC_015562	AC	3	6	38695	38700	50 %	0 %	0 %	50 %	333909927
1060	NC_015562	A	7	7	38744	38750	100 %	0 %	0 %	0 %	333909927
1061	NC_015562	GTTAAG	2	12	38757	38768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333909927
1062	NC_015562	ATT	2	6	38825	38830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333909927
1063	NC_015562	CAA	2	6	38978	38983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333909928
1064	NC_015562	CTT	2	6	38992	38997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333909928
1065	NC_015562	TCT	2	6	39071	39076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333909928
1066	NC_015562	TCA	2	6	39079	39084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333909928
1067	NC_015562	TTG	2	6	39113	39118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333909928
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1069	NC_015562	TACA	2	8	39143	39150	50 %	25 %	0 %	25 %	333909928
1070	NC_015562	T	6	6	39189	39194	0 %	100 %	0 %	0 %	333909928
1071	NC_015562	CAA	2	6	39218	39223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333909928
1072	NC_015562	TTC	2	6	39229	39234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333909928
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1075	NC_015562	T	6	6	39357	39362	0 %	100 %	0 %	0 %	333909928
1076	NC_015562	TCC	2	6	39462	39467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333909928
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1081	NC_015562	CTC	2	6	39585	39590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333909928
1082	NC_015562	AAT	2	6	39591	39596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333909928
1083	NC_015562	TCC	2	6	39603	39608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333909928
1084	NC_015562	TTC	2	6	39616	39621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333909928
1085	NC_015562	CTT	2	6	39629	39634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333909928
1086	NC_015562	CTT	2	6	39650	39655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333909928
1087	NC_015562	CAA	2	6	39677	39682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333909928
1088	NC_015562	TCC	2	6	39696	39701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333909928
1089	NC_015562	AAC	3	9	39720	39728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333909928
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1091	NC_015562	TTC	2	6	39771	39776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333909928
1092	NC_015562	CTC	2	6	39783	39788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333909928
1093	NC_015562	TGT	2	6	39818	39823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333909928
1094	NC_015562	T	6	6	39825	39830	0 %	100 %	0 %	0 %	333909928
1095	NC_015562	T	7	7	39879	39885	0 %	100 %	0 %	0 %	333909928
1096	NC_015562	CAA	2	6	39915	39920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333909928
1097	NC_015562	CTT	2	6	39980	39985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333909928
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1099	NC_015562	T	6	6	40105	40110	0 %	100 %	0 %	0 %	333909928
1100	NC_015562	CT	4	8	40129	40136	0 %	50 %	0 %	50 %	333909928
1101	NC_015562	CTC	3	9	40139	40147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333909928
1102	NC_015562	CAA	2	6	40152	40157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333909928
1103	NC_015562	T	6	6	40182	40187	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_015562	CTAT	2	8	40193	40200	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1105	NC_015562	AATTT	2	10	40240	40249	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_015562	GAA	2	6	40273	40278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_015562	AAG	2	6	40342	40347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_015562	TTA	2	6	40458	40463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_015562	TAT	2	6	40500	40505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_015562	CA	3	6	40518	40523	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1111	NC_015562	GTT	3	9	40558	40566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333909929
1112	NC_015562	A	8	8	40599	40606	100 %	0 %	0 %	0 %	333909929
1113	NC_015562	A	6	6	40620	40625	100 %	0 %	0 %	0 %	333909929
1114	NC_015562	GGA	2	6	40651	40656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333909929
1115	NC_015562	ATT	2	6	40699	40704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333909929
1116	NC_015562	A	7	7	40740	40746	100 %	0 %	0 %	0 %	333909929
1117	NC_015562	TGA	2	6	40772	40777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333909929
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1120	NC_015562	AAT	2	6	40851	40856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333909929
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1124	NC_015562	A	8	8	40926	40933	100 %	0 %	0 %	0 %	333909929
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1126	NC_015562	ATT	2	6	41019	41024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333909929
1127	NC_015562	AAT	2	6	41058	41063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333909929
1128	NC_015562	TTG	3	9	41075	41083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333909929
1129	NC_015562	GTT	2	6	41104	41109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333909929
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1131	NC_015562	GA	3	6	41150	41155	50 %	0 %	50 %	0 %	333909929
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